曲靖市第二人民医院前身为昆明红十字会医院（1965年改为昆明市第三人民医院），始建于1928年，1970年由昆明搬迁至曲靖，改名为云南8511医院，隶属云南省国防科工办，1986年移交曲靖地区，改名为曲靖地区第二人民医院，1997年撤地设市，更名为曲靖市第二人民医院，经云南省卫计委2015年3月20日正式批准为集医疗、教学、科研、预防、保健于一体三级甲等综合医院。为上海复旦大学附属中山医院对口援建医院，为四川大学华西医院/华西第二人民医院区域联盟网络医院，是云南中医学院附属曲靖综合医院、曲靖医学高等专科学校的非直属附属医院，承担着全市及周边地区人民群众的医疗救治和突发公共卫生事件救治等任务。

医院占地面积56亩，业务用房面积87902m2，设有机关职能科室20个、临床专业科室28个，医技科室10个。其中肝胆外科于1991年2月率先在中国开展了“腹腔镜胆囊摘除术”，享有“中国微创外科发源地”的美誉。

全院现有职工1203人，在编人员522人，编外人员681人；卫生专业技术人员942人，教授38人，副教授117人，讲师226人，硕士研究生46人，享有国务院特殊津贴1人，省政府特殊津贴3人，市政府特殊津贴8人，市级突出贡献专业技术人员6人，市中青年学术技术带头人7人，曲靖市首席专家8人。编制床位数800张，实际开放1200张，拥有1.5T超导核磁共振、GE64排128层螺旋CT、ECT、DSA、C臂X光机、DR系统、全自动生化分析仪、蔡司显微镜等大型综合设备，2007年建成曲靖市首家静脉药物配制中心。2011年，建成省内一流的净化手术室、数字化手术间及影像传输系统满足临床及学术需要，同年建成省内首家药房自动化和小车轨道物流配送系统。

2009年以来先后获评“全国五一劳动奖状单位”,“全国医药卫生系统先进集体”, “国家级第二批节约型公共机构示范单位”,2009年、2012年、2015年连续三届荣获“省级文明单位”。系上海消化内镜诊疗工程技术研究中心曲靖基地、暨南大学微创外科研究所基地、广州国际减重与糖尿病外科治疗中心曲靖基地；上海消化内镜诊疗工程技术研究中心·中山医院·曲靖市二院合作中心、云南省住院医师规范化培训基地；系曲靖市微创外科临床诊疗中心、曲靖市眼科疾病临床诊疗中心、曲靖市健康体检中心；肝胆外科、临床护理专业为曲靖市临床重点专科；普通外科、血液内科、消化内科专业为云南省省级重点专科建设项目。四级妇科内镜技术、经皮冠状动脉介入技术、永久性起搏器植入技术等12项二类技术获准机构和人员资质准入。

2007年以来，获省市级科学技术成果奖30余项，其中《腹腔镜微创技术在肝病治疗中的临床应用》获2014年度云南省政府科学技术奖三等奖。现在建心血管内科“葛均波院士工作站”、消化内科“周平红专家工作站”、胃肠外科“汪建平专家工作站”、肝胆一外科“王存川专家工作站”，泌尿外科“李建兴专家工作站”，耳鼻咽喉科“龚树生耳科专家工作站”，肾病风湿免疫科“张维亚专家工作站”等。